Для развития интеллектуальных, творческих, физических возможностей учащихся в ДЭЦ «Балдырган» функционирует 61 клуб по направлениям «Декоративно-прикладное искусство, Музыка, Наука и техника, Театр, Творчество, Хореография, Спорт, Военно-патриотическое воспитание». Деятельность клубов осуществляется в рамках шестидневной учебной недели, занятия проводятся в две смены по расписанию, составленному с учетом санитарно-гигиенических требований и возрастных особенностей воспитанников.