Одним из приоритетных направлений деятельности, как Министерства обороны, так и Главного управления военной полиции является противодействие коррупции.

Основными задачами являются:

1) предупреждение коррупции в Вооруженных Силах, выявление административных коррупционных правонарушений в пределах компетенции, установленной законами Республики Казахстан;

2) проведение полиграфологического исследования в отношении военнослужащих и гражданского персонала Вооруженных Сил, назначаемых на должности с высоким риском совершения коррупционных правонарушений.

Подразделением обеспечивается реализация Плана мероприятий Министерства обороны Республики Казахстан по реализации Концепции антикоррупционной политики Республики Казахстан на 2022–2026 годы, функционирование на сайте Министерства обороны специального раздела по противодействию коррупции, проведение тестирования на знание законодательства о противодействии коррупции и антикорруционных стандартов Вооруженных Сил, проведение в воинских частях и учреждениях проверок соблюдения военнослужащими требований законодательства о противодействии коррупции, контроль за деятельностью гарнизонных комиссий по противодействию коррупции.

Основной акцент работы сделан на принятии таких превентивных мер противодействия коррупции, как антикоррупционный мониторинг, анализ коррупционных рисков, соблюдение антикоррупционных стандартов, формирование антикоррупционной культуры военнослужащих.