Основными задачами Управления медицинского образования являются формирование и реализация государственной политики, осуществление межотраслевой координации и государственное управление в области медицинского и фармацевтического образования.
В перечень направлений деятельности Управления медицинского образования входят: участие в разработке и реализации программ в области здравоохранения, совершенствование отраслевой системы квалификации специалистов в области здравоохранения, выработка и реализация мероприятий по внедрению института независимой оценки знаний и навыков выпускников медицинских ВУЗов, колледжей, совершенствование номенклатуры и квалификационных характеристик медицинских и фармацевтических специальностей, размещение государственного образовательного заказа на подготовку медицинских кадров, организация подготовки кадров в области здравоохранения, в том числе и за рубежом, формирование бюджетных заявок с обоснованиями и обеспечение реализации (исполнение) закрепленных бюджетных программ (мероприятий), участие в разработке Стратегического и операционного планов Министерства и обеспечение их исполнения по закрепленным республиканским бюджетным программам (мероприятиям), проведение анализа и мониторинга реализации курируемых бюджетных программ, формирование перечня приоритетных направлений для присуждения международной стипендии «Болашак» по медицинским и фармацевтическим специальностям.
В компетенцию Управления медицинского образования входит планирование медицинских кадров и размещение государственного образовательного заказа на их подготовку.
С целью обеспечения квалифицированными специалистами Управления медицинского образования ежегодно выделяется государственный образовательный заказ на подготовку медицинских кадров в бакалавриате, интернатуре, резидентуре, магистратуре, докторантуры.