Бағыт бойынша мекемелер: Салықтық әкімшілендіру
Жеке тұлғалардың кірістерін әкімшілендіру басқармасы
Өндірістік емес төлемдерді әкімшілендіру басқармасы
Мемлекеттік кірістер комитетінің Алдын ала тексеру актілерін қарау басқармасы
ҚР ҚМ Мемлекеттік кірістер комитетінің Өндірістік емес төлемдерді және жеке тұлғаларды әкімшілендіру департаменті
ҚР ҚМ Мемлекеттік кірістер комитеті Өндірістік емес төлемдерді, жеке тұлғаларды және арнаулы салық режимдерін әкімшілендіру департаменті Арнаулы салық режимдерін әкімшілендіру және жеке тұлғалардың кәсіпкерлік қызметі әкімшілендіру басқармасы
Жеке тұлғалардың активтері мен берешегін әкімшілендіру басқармасы
Мемлекеттік кірістер комитетінің Аудит департаменті
Салықтық әкімшілендіру департаменті
Қазақстан Республикасы Қаржы министрлігі Мемлекеттік кірістер комитетінің Әдіснама департаменті
ҚР ҚМ Мемлекеттік кірістер комитеті Әкімшілендіру департаменті Қосылған құн салығын әкімшілендіру басқармасы