Бағыт бойынша мекемелер: Кедендік әкімшілендіру
ҚР ҚМ Мемлекеттік кірістер комитетінің Өндірістік емес төлемдерді және жеке тұлғаларды әкімшілендіру департаменті
Мемлекеттік кірістер комитетінің Тауарларды жіктеу және шығарылған жері басқармасы
Мемлекеттік кірістер комитетінің Кедендік операциялар басқармасы
ҚР ҚМ Мемлекеттік кірістер комитеті Бақылау департаментінің Транзит басқармасы
Мемлекеттік кірістер комитетінің Саудалық емес айналым басқармасы
Мемлекеттік кірістер комитетінің Бақылау департаменті
Қазақстан Республикасы Қаржы министрлігі Мемлекеттік кірістер комитетінің Әдіснама департаменті
Қазақстан Республикасы Қаржы министрлігінің Мемлекеттік кірістер комитеті Әдіснама департаменті Кедендік әдіснама басқармасы
ҚР ҚМ МКК Бақылау департаменті Өткізу пункттерін үйлестіру басқармасы