Миссия: создание условий по сохранению, восстановлению и улучшению качества окружающей среды, биологического разнообразия, водообеспечение отраслей экономики и окружающей среды, рациональное использование природных ресурсов и обеспечение экологической безопасности для жизни и здоровья человека, экономики, бизнеса, повышение геологической изученности территории и восполнение минерально-сырьевого комплекса Республики Казахстан, обеспечение перехода Республики Казахстан к низкоуглеродному развитию и «зеленой экономике» для удовлетворения потребностей нынешнего и будущих поколений по устойчивому использованию водных ресурсов, развитию лесного хозяйства и животного мира, развитию системы управления отходами, снижению загрязнения воздуха и сохранению и эффективному управлению экосистемами.