Трефилов Эммануил Иванович после окончания Томского политехнического института всю свою трудовую деятельность посвятил энергетике Восточного Казахстана. Более 40 лет трудился на Бухтарминской гидроэнергетической станции, где прошел путь от начальника электротехнической лаборатории электромашинного цеха до директора станции.
Являясь директором Бухтарминской гидроэнергетической станции, затем гидроэнергетического комплекса в составе акционерного общества «Казцинк», Трефилов Э.И. уделял огромное внимание технической модернизации станции, был инициатором ее реконструкции, что позволило предприятию ежегодно увеличивать выработку электроэнергии, работать стабильно и безаварийно. Под его руководством и при непосредственном участии в последние годы на гидростанции проводились широкомасштабные реконструктивные работы, позволившие более эффективно использовать водные ресурсы Бухтарминского водохранилища. Сформирован высокопрофессиональный коллектив рабочих и инженерно-технических работников, который на высоком уровне решает поставленные задачи.
Являясь одной из самых крупных электростанций Казахстана, Бухтарминская гидроэнергетическая станция, предприятие, которым в течение 20 лет руководил Трефилов Э.И., вносит существенный вклад в экономику города Серебрянска, района и республики в целом.
Коллектив гидроэнергетического комплекса оказывает помощь социальной сфере города Серебрянска, другим предприятиям, ежегодно оказывает благотворительную помощь школам города, дому-интернату для престарелых, детскому дому для детей-сирот с задержкой психического развития, уделяет большое внимание развитию спорта среди молодежи.
Многолетний добросовестный труд Эммануила Ивановича высоко оценен различными наградами и званиями. Награжден юбилейной медалью в честь 10-летия Независимости Республики Казахстан, имеет благодарственное письмо Президента Республики Казахстан. За вклад в развитие Бухтарминской гидроэлектростанции отмечен Почетной грамотой Министерства энергетики Казахской ССР, Почетной грамотой ЦК профсоюзов работников электростанций и электрической промышленности СССР, Почетной грамотой АО «Казцинк», ценными подарками. Его имя занесено в Книгу Почета Бухтарминской ГЭС.
За существенный вклад в развитие интеграционных процессов в энергетике государств- участников Содружества независимых государств Трефилову Э.И. присвоено почетное звание «Заслуженный энергетик СНГ», его имя занесено в энциклопедию энергетики стран СНГ. За особый вклад в становление и развитие акционерного общества «Казцинк» в 2003 году он награжден Серебряным знаком отличия АО «Казцинк», в 2005 году награжден высшей наградой компании- Золотым знаком отличия АО «Казцинк». Как заслуженный работник и ветеран энергетики Казахстана Трефилов Э.И. награжден памятным знаком «80 лет ГОЭРЛО».
В соответствии с решением маслихата Зыряновского района № 32/13-3 от 15.02.2006 года Трефилову Эммануилу Ивановичу присвоено звание «Почетный гражданин Зыряновского района».