В пределах территориальных вод (моря) и внутренних вод действует режим территориальных вод (моря) и внутренних вод, которым устанавливается порядок:

учета, содержания, выхода из пунктов базирования и возвращения в пункты базирования, пребывания на воде казахстанских маломерных самоходных и несамоходных (надводных и подводных) судов (средств) и средств передвижения по льду в территориальных водах (море) и внутренних водах;

плавания (эксплуатации) в территориальных водах (море) и внутренних водах казахстанских судов, иностранных судов и военных кораблей, средств передвижения по льду;

ведения в территориальных водах (море) и внутренних водах промысловой, исследовательской, изыскательской или иной деятельности, в том числе направленной на сохранение природных минеральных или живых ресурсов континентального шельфа.

Режим территориальных вод (моря) и внутренних вод устанавливается Законом «О Государственной границе Республики Казахстан» и международными договорами, ратифицированными Республикой Казахстан.

Основным назначением режима территориальных вод (моря) и внутренних вод является создание необходимых условий для защиты Государственной границы.