Сотрудничество между Республикой Казахстан и Российской Федерацией в сфере использования и охраны трансграничных водных объектов осуществляется по 20 трансграничным рекам, основными из которых являются Урал, Есиль, Тобол, Ертис, Большой и Малый Узени.
Договорно-правовая база РК и РФ в сфере использования и охраны трансграничных водных объектов состоит из следующих основных документов:
1) Соглашение между Правительством Республики Казахстан и Правительством Российской Федерации о совместном использовании и охране трансграничных водных объектов от 7 сентября 2010 г. (взамен Соглашения между Правительством РК и Правительством РФ о совместном использовании и охране трансграничных водных объектов от 27 августа 1992 г.).
2) Соглашение между Правительством РК и Правительством РФ о сотрудничестве в области охраны окружающей среды от 22 декабря 2004 г.;
В настоящее время функционирует Казахстанско-Российская комиссия по совместному использованию и охране трансграничных водных объектов (далее - Комиссия).
В период с 1993 г. по 2015 г. проведены 23 заседаний Комиссии.
Сопредседателями Комиссии являются вице-министр сельского хозяйства РК и заместитель руководителя Федерального Агентства водных ресурсов.
В рамках Комиссии сформированы следующие рабочие группы:
1) Рабочая группа по бассейну реки Урал,
2) Рабочая группа по бассейну р.Иртыш,
3) Рабочая группа по бассейну р.Ишим,
4) Рабочая группа по бассейну р.Тобол,
5) Рабочая группа по бассейну рек Большой и Малый Узени
6) Рабочая группа по протоку Кигач (р.Волга).
Благодаря заседаниям Комиссии и ее рабочих групп достигнут весомый прогресс в двустороннем водном сотрудничестве. Особое внимание в ходе консультаций уделяется вопросам сохранения экосистем трансграничных рек.
В рамках Комиссии рассматриваются состояние и результаты мониторинга водных ресурсов трансграничных рек, проведение совместных проверок хозяйственной деятельности предприятий, влияющих на состояние водных ресурсов, пропуск паводков, наполнение водохранилищ и условия водообеспечения населения и отраслей экономики.