В Жанакорганском районе функционирует 1 центральная больница, 2 сельские больницы, 1 центральная поликлиника, 17 врачебных амбулаторий, 8 фельдшерско-акушерских пунктов, 10 медицинских пунктов (100%).

За 6 месяцев 2023 года были оказаны медицинские услуги в рамках дорожных карт, разработанных с целью обеспечения интегрированного подхода в оказании медицинской помощи населению района. 74209 жителей района обслужены центральной круглосуточной больницей на 185 коек, 2 сельские больницы (Томенарык 10 коек, Кандоз 5 коек), 1 районная поликлиника, 17 врачебных амбулаторий, 8 фельдшерско-акушерских пунктов, 10 медицинских пунктов, 50 практикующих врачебных участков. Нагрузка на 1 практикующего врача в среднем составляет 1484.