Департамент охраны здоровья матери и ребенка состоит из Управления охраны здоровья матерей; Управления охраны здоровья детей и подростков; Управления медико-социальной реабилитации. Департамент реализует государственную политику по вопросам охраны здоровья матерей и репродуктивному здоровью женщин; формирует государственную политику в области охраны здоровья новорожденных, детей и подростков в возрасте от 0 до 17 лет включительно, формирует государственную политику в области оказания и совершенствования медико-социальной реабилитации детей и подростков в рамках ГОБМП и в системе ОСМС.