Патент алу үшін кәсіпкер алдымен жеке кәсіпкер ретінде тіркелуі керек. Егер кәсіпкер ЖК ретінде тіркеу туралы хабарламада рұқсат етілген қызмет түрлерінің тізбесіне сәйкес келмейтін қызмет түрін көрсетсе (Салық кодексінің 685-бабы), онда кәсіпкер патент ала алмайды. Патент негізінде арнайы салық режимін қолдану үшін орналасқан жері бойынша салық органына патент құнының есебі (есеп) ұсынылады.
Есеп қағаз жеткізгіште немесе электрондық нысанда, оның ішінде «электрондық үкімет» веб-порталы арқылы ұсынылады, ЖК:
Есептеу патенттің құнын есептеу үшін салық есептілігі болып табылады (911.00-нысан). Патенттің қолданылу кезеңінде алуды жоспарлап отырған табыс сомасын салық төлеушінің өзі айқындайды. Патент құнын төлеуді салық төлеуші есеп ұсынылғанға дейін жүргізеді. Патенттің құнына төленуге жататын жеке табыс салығының (төлем көзінен ұсталатын жеке табыс салығынан басқа) және әлеуметтік төлемдердің сомалары енгізіледі. Патент құнына енгізілетін жеке табыс салығының сомасын есептеу болжамды табысқа 1 пайыз мөлшерінде мөлшерлемені қолдану жолымен жүргізіледі.
Патент құнына енгізілетін әлеуметтік төлемдерді есептеу «Қазақстан Республикасында зейнетақымен қамсыздандыру туралы», «Әлеуметтік кодекс» және «Міндетті әлеуметтік медициналық сақтандыру туралы» Қазақстан Республикасының заңдарына сәйкес жүргізіледі.
Егер патенттің қолданылу мерзімі ішінде нақты алынған табыс сомасы есепте көрсетілген табыс мөлшерінен асып кетсе, ЖК 5 жұмыс күні ішінде есепті асып кеткен сомаға қосымша салық есептілігі түрінде ұсынуға және осы сомадан салық төлеуді жүргізуге міндетті.
Егер патенттің қолданылу мерзімінен кейін кәсіпкер қызметін жалғастыруды жоспарласа, онда келесі патентті алдыңғы патенттің қолданылу мерзімі аяқталғанға дейін сатып алу қажет. Егер ЖК салық режимін өзгертуді жоспарласа, ауысым туралы хабарлама, ауысу жоспарланған айдың басталуына дейін берілуі керек.
Егер қызметті тоқтата тұру жоспарланса, тоқтата тұру туралы өтініш ағымдағы патент аяқталған күнге дейін де берілуі керек.
Егер кәсіпкер қолданылу мерзімі аяқталғаннан кейін патентті жай ғана «тастап кетсе», бірақ қызметін тоқтата тұру туралы өтініш бермесе, онда патенттің қолданылу мерзімі өткен күннен бастап күнтізбелік алпыс күн ішінде салық органы дара кәсіпкер ретінде тіркеу есебінен шығаруға жатады.