Қоңыр ауылдық округінде 2 медициналық пункт қызмет көрсетуде. Олар : Қоңыр және Көктөбе ауылдарында орналасқан.
Негізгі мақсаттар-жұмыстағы жоғары кәсібилік, округ тұрғындарының денсаулығын қалпына келтіру және нығайту, аурулардың алдын алу.