"Мерке" шипажайы Мерке аудан орталығынан 12 км қашықтықта орналасқан және Қырғыз Алатауының кең Меркі шатқалында, теңіз деңгейінен 750 м биіктікте орналасқан. Шатқалдың түбінде "Меркенка" өзені ағып жатыр, оның жұмсақ жағалауларында жапырақты ағаштар мен бұталар кең лентамен өседі. Жылы мезгілде орман алқабы әр түрлі құс тұқымдарының әні мен гомонына толы.
Мерке ауылынан шипажайға дейін асфальтталған жол баяу көтеріліп, тауға шығады, келген науқастар шипажайға жеті жүз елу метр биіктікке көтерілгенін байқамайды. Өзеннің сол жағалауында шамамен 10 га аумақта 500 орындық науқастарға арналған тұрғын үй ғимараттары, емдік ғимараттар, терренкурлар, демалыс аймақтары және шаруашылық қызметтерге арналған үй-жайлар орналасқан.
Шипажай жыл бойы жұмыс істейді. Жылдың кез-келген маусымында радонмен емдеу қолайлы.
Шипажайдағы көктем ерте: қар тез еріп, таулар барқыт жасыл кілеммен жабылған. Кейде найзағай жауады. Жазда жаңбыр аз қайталанады. Ыстық күндерде шипажайдағы жылу салыстырмалы түрде оңай тасымалданады: ауаның жылуы өзеннің суық суымен және жеңіл желмен сөнеді, ол күндіз жылы ауаны тауларға апарады, ал түнде таулардан жылынған жерге салқындық әкеледі. Күз құрғақ, аяздың баяу басталуымен ұзақ. Қыс қар жамылғысымен бірге жүреді, бірақ үлкен аязсыз.
Жыл бойына санаторийдің климаттық жағдайлары пациенттерге климаттық қозғалыс режимінің барлық түрлерімен және дененің қатаюымен айналысуға мүмкіндік береді.
"Мерке" санаторийінің негізгі емдік факторы радонды минералды су болып табылады. Бұл радон суы аз минералданған салқын, хлорид-сульфат-гидрокарбонат, кальций-калий-натрийге жатады. Судағы радонның мөлшері жыл мезгіліне байланысты 90-нан 130 н/к/литрге дейін, судың РН-8,2.
Ұңғымалардан алынған минералды радон суы - 23° градус температурада өздігінен құйылады, ол адам денесінің температурасына дейін қызады (36° - 37°), процедураларды босату үшін радон ванналары.