Оқушылардың зияткерлік, шығармашылық, дене мүмкіндіктерін дамыту үшін «Балдырған» ЭСО-да «Сәндік-қолданбалы өнер, Музыка, Ғылым және техника, Театр, Шығармашылық, Хореография, Спорт, Әскери-патриоттық тәрбие» бағыттары бойынша 61 клуб жұмыс істейді. Клубтардың қызметі алты күндік оқу аптасы шеңберінде жүзеге асырылады, сабақтар санитарлық-гигиеналық талаптарды және тәрбиеленушілердің жас ерекшеліктерін ескере отырып жасалған кесте бойынша екі ауысымда өткізіледі.