Советы по этике Агентства образованы в 2016 году на базе ранее действовавших Дисциплинарных советов.
Главная цель их создания была в смещении приоритетов с рассмотрения дисциплинарных проступков служащих, на обеспечение в госорганах высоких этических стандартов и профилактику нарушений этических правил.
Советы по этике наряду с рассмотрением дисциплинарных дел наделены правом рассмотрения результатов анализа коррупционных рисков, вопросов по профилактике нарушений законодательства, деятельности уполномоченных по этике и деятельности дисциплинарных комиссий госорганов.