28 декабря 1991 г. Япония признала независимость РК.
26 января 1992 г. установлены дипломатические отношения.
В январе 1993 г. открыто Посольство Японии в РК.
В феврале 1996 г. открыто Посольство РК в Японии.
С декабря 2024 г. Посол РК в Японии – Ерлан Баударбек-Кожатаев.
С октября 2024 г. Посол Японии в РК – Ясумаса Ииджима.
Контакты на высшем уровне:
В 1994, 1999, 2008, 2016, 2019 гг. состоялись визиты Президента РК Н.А.Назарбаева в Японию.
В 2006 г. Премьер-министр Японии Д.Коидзуми, в 2015 г. Премьер-министр Японии Ш.Абэ совершил визит в Казахстан.
12 мая 2021 г. состоялся телефонный разговор Президента РК К.К.Токаева с Премьер-министром Японии Ё.Суга.
9 августа 2024 г. состоялся телефонный разговор Президента РК К.К.Токаева с Премьер-министром Японии Ф.Кишида.
17-19 декабря 2025 г. Президент РК К.К.Токаев совершил официальный визит в Японию.
20 декабря 2025 г. Президент РК К.К. Токаев принял участие в первом саммите Диалога «Центральная Азия + Япония».
Контакты на высоком уровне:
В 2002 г. состоялся официальный визит Государственного секретаря – Министра иностранных дел РК К.К.Токаева в Японию.
В 2004 г. Министр иностранных дел Японии Ё.Кавагучи приняла участие в 1-й Министерской встрече Диалога «Центральная Азия + Япония» в Астане.
В 2005 г. Премьер-Министр РК Д. Ахметов посетил Японию.
В 2009, 2010 гг. состоялись визиты Госсекретаря – Министра иностранных дел РК К.Саудабаева в Японию.
В 2012 г. Министр иностранных дел РК Е. Идрисов посетил визитом Японию.
В 2022 г. Министр иностранных дел Японии Ё.Хаяши посетил визитом Казахстан.
В 2022 г. Заместитель Премьер-министра – Министр иностранных дел РК М.Тлеуберди принял участие в церемонии государственных похорон бывшего Премьер-министра Японии Ш.Абэ.
В 2022 г. Заместитель Премьер-министра РК – Министр иностранных дел РК М. Тлеуберди принял участие в 9-м СМИД ДЦАЯ (г. Токио).
В 2023 г. Заместитель Премьер-министра – Министр иностранных дел РК М.Нуртлеу провел встречу с Министром иностранных дел Японии Ё.Камикава «на полях» ГА ООН.
В 2024 г. состоялся рабочий визит Заместителя Министра иностранных дел РК Н.Нурбаевой в г. Токио.
В 2024 г. Заместитель Министра иностранных дел Японии К.Цуджи с рабочим визитом посетил г. Алматы.
В 2024 г. Заместитель Премьер-министра – Министр иностранных дел РК М.Нуртлеу провел телефонный разговор с Министром иностранных дел Японии Т.Ивая.
В 2025 г. Заместитель Премьер-министра Республики Казахстан — Министр иностранных дел М. Нуртлеу совершил официальный визит в Японию.
В 2025 г. Министр иностранных дел Японии Т.Ивая посетил Казахстан с ответным визитом.
Сотрудничество в сфере нераспространения и разоружения:
Япония выступила соавтором резолюции ГА ООН по Семипалатинскому региону и стала инициатором проведения в г.Токио в сентябре 1999 г. международной конференции по проблемам бывшего Семипалатинского полигона.
С марта 1998 г. ведутся совместные работы по изучению последствий ядерных испытаний на территории РК. Налажены тесные контакты между медицинскими и общественными учреждениями гг. Семей, Хиросима и Нагасаки.
Япония стала соавтором резолюции ГА ООН, провозгласившей 29 августа – Международным днем действий против ядерных испытаний.