Қаржылық есептілік аудитінің негізгі мақсаты – Қазақстан Республикасының Ұлттық Банкін қоспағанда, бюджеттік бағдарламалар әкімшілері мен мемлекеттік мекемелердің қаржылық есептілігінің анықтығын негізделген растауды алу болып табылады.
2019 жылдың жұмыс жоспарына сәйкес Департамент 18 мемлекеттік мекемелерде қаржылық есептілік аудитін жүргізіп олардың 16- да бұзушылықтар анықтап, анықталған бұзушылықтарды жою және оларға жол берген тұлғалардың жауапкершілігін қарау туралы нұсқама енгізілді.
Аудит нысандарымен бұзушылықтар есепке алу бойынша көрсету жолымен қалпына келтірілді.