Информация по «Лабораторной диагностике коронавирусной инфекции»

            В настоящее время в основе стандартного способа подтверждения острой инфекции, вызванной вирусом SARS-CoV-2, лежит определение уникальных последовательностей вирусного генома методами амплификации нуклеиновых кислот (МАНК), например методом полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией в режиме реального времени. К числу мишеней относятся области генов вируса N, E, S и RdRP. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) – экспериментальный метод молекулярной биологии, позволяющий добиться значительного увеличения малых концентраций определенных фрагментов нуклеиновой кислоты (НК) в биологическом материале (пробе).

            После заражения человека вирусом SARS-CoV-2 период до возникновения симптомов заболевания (инкубационный период) в среднем составляет 5–6 дней и находится в диапазоне от 1 до 14 дней от момента контакта с источником инфекции. Вирус может определяться в верхних дыхательных путях (далее - ВДП) за 1–3 дня до появления симптомов заболевания. Самая высокая концентрация вируса SARS-CoV-2 в ВДП приходится практически на то же время, что и дебют симптомов, после чего она начинает постепенно снижаться. На второй неделе болезни отмечается появление вирусной РНК в нижних дыхательных путях (далее - НДП). Двумя приоритетными направлениями для содействия клиническому ведению случаев заболевания и инфекционному контролю являются оперативный сбор соответствующего материала, а также тщательная лабораторная диагностика. Вид материала, в наибольшей степени пригодного для исследования, определяется клинической картиной и временем, прошедшим с момента появления симптомов заболевания. Материал из верхних дыхательных путей пригоден для выявления инфекции на ранней стадии, особенно у пациентов с бессимптомным или легким течением заболевания. Показано, что чувствительность теста на определение респираторных вирусов возрастает, и надежность результата повышается при исследовании материала комбинированного мазка из носоглотки и ротоглотки, взятого у одного и того же пациента. Материал из нижних дыхательных путей более предпочтителен на более поздних этапах COVID-19, а также при обследовании пациентов, у которых результат исследования материала из ВДП отрицателен, однако имеются весомые основания для клинического подозрения на COVID-19. Материалом из НДП может служить мокрота в случае ее спонтанного образования, эндотрахеальный аспират либо промывные воды бронхов у пациентов с более тяжелым течением респираторного заболевания. Материал для определения вируса должен поступать в лабораторию в кратчайшие сроки после сбора. Важно соблюдать правила обращения с образцами во время транспортировки.