Еуразиялық экономикалық одақ құру идеясы Қазақстан Республикасының Тұңғыш Президенті - Елбасы Нұрсұлтан Назарбаевқа тиесілі, ол 1994 жылы 29 наурызда Мәскеу мемлекеттік университетінде дәріс оқыды. Ломоносов М.В. Тұңғыш Президенттің бастамасы 20 жылдан кейін ғана шындыққа айналды және бұл экономикалық одаққа кірген посткеңестік республикалар үшін тарихи оқиға болды. Еуразиялық экономикалық одақ туралы шартқа 2014 жылдың 29 мамырында Қазақстанның астанасында қол қойылды. Бұл құжат Одаққа мүше мемлекеттердің экономикасын дамыту үшін ұзақ мерзімді тұрақты жағдайларды қамтамасыз ететін еуразиялық интеграцияны дамытудың негізін қалады, сонымен қатар төрт бостандықты жүзеге асыруға мүмкіндіктер жасады: тауарлардың, капиталдың қозғалысы, қызметтер мен жұмыс күші. Келісім Еуразиялық экономикалық жобаның интеграцияның жаңа, терең деңгейіне көшуін белгіледі.
2014 жылғы 4 желтоқсанда Армения парламенті елдің ЕАЭО-ға қосылуы туралы келісімді ратификациялады. 2014 жылдың 23 желтоқсанында Жоғары Еуразиялық экономикалық кеңестің отырысында Қырғызстанның ЕАЭО-ға қосылуы туралы келісімге қол қойылды. 2015 жылдың 1 қаңтарында Еуразиялық экономикалық одақ құру туралы келісім күшіне енді. 2015 жылдың 2 қаңтарында Армения ЕАЭО-қа ресми түрде қосылды. 2015 жылы тамызда Қырғызстанның Еуразиялық экономикалық одаққа кіру процедурасы аяқталды.
2018 жылдың 1 қаңтарынан бастап ЕАЭО жаңа Кеден кодексі күшіне енді. Бұл Одақтың кедендік шекарасы арқылы тауарларды өткізу процедурасын жеңілдетіп, оны мөлдір етті, оның ішінде декларациялаудың электронды жүйесін енгізу арқылы. ЕАЭО-ның ортақ нарығына тауарларды шығаруға қатысты барлық рәсімдер біріздендірілді. Кодтың арқасында тауарларды еркін айналымға шығару уақыты алты есеге, ал кедендік декларацияны тіркеу екі есеге қысқарды.
Бүгінгі күні ЕАЭО аумағында мүше мемлекеттер арасындағы кедендік шекаралар алынып тасталды, бірыңғай Кеден кодексінің нормалары, Бірыңғай кедендік тариф, сыртқы сауда мен кедендік реттеудің бірыңғай жүйесі және бірыңғай техникалық регламенттер қолданылады.