Бюджетная программа администратора республиканских бюджетных программ, разрабатывающего стратегический план, определяет направление расходов республиканского бюджета, взаимоувязанное с целями, определенными в стратегическом плане. Бюджетная программа разрабатывается на плановый период ежегодно на скользящей основе администратором бюджетных программ и содержит показатели прямого и конечного результатов, объемы планируемых бюджетных средств на плановый период. Бюджетные программы администраторов республиканских бюджетных программ, разрабатывающих стратегические планы, утверждаются администраторами бюджетных программ по согласованию с центральным уполномоченным органом по бюджетному планированию. Бюджетная программа Агентства на 2020 год утверждена Приказом Агентства №149 от 28.02.2020 года "Об утверждении Бюджетной программы Агентства Республики Казахстан по регулированию и развитию финансового рынка на 2020 год", по согласованию с Министерством Финансов Республики Казахстан.