Қаныбеков Сәкен Әсембекұлы Түркістан облысының Төлеби ауданында дүниеге келген, «Жеміс-көкөніс және жүзім шаруашылығы» және «Экономика» мамандықтары бойынша екі жоғары білімі бар.
Еңбек жолын 1992 жылы Алматы облысы Талғар ауданы Мичурин атындағы колхоз мүшесі, бригадир көмекшісі, бас агроном орынбасары болып бастаған.
1992–1995 жылдары — «Бақтілеу» фирмасында халық тұтынатын тауарларды сату цехының бастығы, директор орынбасары, Алматы қаласы.
1995–2000 жылдары — «Заман» ЖШС директор орынбасары, Алматы қаласы.
2000–2006 жылдары Шымкент қаласындағы «НИМЭКС корпорациясы» ЖШС-да түрлі лауазымды қызметтер атқарды.
2006–2009 жылдары — Оңтүстік Қазақстан облысы Ордабасы ауданының әкімі
2009–2010 жылдары — ҚР Президенті Әкімшілігінің ұйымдастыру-аумақтық және мемлекеттік бақылау бөлімінің мемлекеттік инспекторы
2010–2016 жылдары — Оңтүстік Қазақстан облысы әкімінің орынбасары
2016–2021 жылдары — ҚР Парламенті Мәжілісінің VI шақырылымындағы депутаты
2021–2022 жылдары — «Оңтүстік-Батыс мал шаруашылығы және өсімдік шаруашылығы ғылыми-зерттеу институты» ЖШС басқарма төрағасы
2024 жылғы 11 қарашадан 2025 жылғы 25 маусымға дейін ҚР АШМ АӨК-дегі мемлекеттік инспекция комитеті төрағасының орынбасары қызметін атқарды
2025 жылғы 25 маусымнан бастап ҚР Ауыл шаруашылығы министрлігінің АӨК-дегі мемлекеттік инспекция комитетінің төрағасы болып тағайындалды.